MySQL · 引擎特性 · InnoDB奔潰恢復

来源:http://www.cnblogs.com/coderyuhui/archive/2017/07/16/7191413.html
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前言 資料庫系統與文件系統最大的區別在於資料庫能保證操作的原子性,一個操作要麼不做要麼都做,即使在資料庫宕機的情況下,也不會出現操作一半的情況,這個就需要資料庫的日誌和一套完善的奔潰恢復機制來保證。本文仔細剖析了InnoDB的奔潰恢復流程,代碼基於5.6分支。 基礎知識 lsn: 可以理解為資料庫從 ...


前言

資料庫系統與文件系統最大的區別在於資料庫能保證操作的原子性,一個操作要麼不做要麼都做,即使在資料庫宕機的情況下,也不會出現操作一半的情況,這個就需要資料庫的日誌和一套完善的崩潰恢復機制來保證。本文仔細剖析了InnoDB的崩潰恢復流程,代碼基於5.6分支。

基礎知識

lsn: 可以理解為資料庫從創建以來產生的redo日誌量,這個值越大,說明資料庫的更新越多,也可以理解為更新的時刻。此外,每個數據頁上也有一個lsn,表示最後被修改時的lsn,值越大表示越晚被修改。比如,數據頁A的lsn為100,數據頁B的lsn為200,checkpoint lsn為150,系統lsn為300,表示當前系統已經更新到300,小於150的數據頁已經被刷到磁碟上,因此數據頁A的最新數據一定在磁碟上,而數據頁B則不一定,有可能還在記憶體中。
redo日誌: 現代資料庫都需要寫redo日誌,例如修改一條數據,首先寫redo日誌,然後再寫數據。在寫完redo日誌後,就直接給客戶端返回成功。這樣雖然看過去多寫了一次盤,但是由於把對磁碟的隨機寫入(寫數據)轉換成了順序的寫入(寫redo日誌),性能有很大幅度的提高。當資料庫掛了之後,通過掃描redo日誌,就能找出那些沒有刷盤的數據頁(在崩潰之前可能數據頁僅僅在記憶體中修改了,但是還沒來得及寫盤),保證數據不丟。
undo日誌: 資料庫還提供類似撤銷的功能,當你發現修改錯一些數據時,可以使用rollback指令回滾之前的操作。這個功能需要undo日誌來支持。此外,現代的關係型資料庫為了提高併發(同一條記錄,不同線程的讀取不衝突,讀寫和寫讀不衝突,只有同時寫才衝突),都實現了類似MVCC的機制,在InnoDB中,這個也依賴undo日誌。為了實現統一的管理,與redo日誌不同,undo日誌在Buffer Pool中有對應的數據頁,與普通的數據頁一起管理,依據LRU規則也會被淘汰出記憶體,後續再從磁碟讀取。與普通的數據頁一樣,對undo頁的修改,也需要先寫redo日誌。
檢查點: 英文名為checkpoint。資料庫為了提高性能,數據頁在記憶體修改後並不是每次都會刷到磁碟上。checkpoint之前的數據頁保證一定落盤了,這樣之前的日誌就沒有用了(由於InnoDB redolog日誌迴圈使用,這時這部分日誌就可以被覆蓋),checkpoint之後的數據頁有可能落盤,也有可能沒有落盤,所以checkpoint之後的日誌在崩潰恢復的時候還是需要被使用的。InnoDB會依據臟頁的刷新情況,定期推進checkpoint,從而減少資料庫崩潰恢復的時間。檢查點的信息在第一個日誌文件的頭部。
崩潰恢復: 用戶修改了數據,並且收到了成功的消息,然而對資料庫來說,可能這個時候修改後的數據還沒有落盤,如果這時候資料庫掛了,重啟後,資料庫需要從日誌中把這些修改後的數據給撈出來,重新寫入磁碟,保證用戶的數據不丟。這個從日誌中撈數據的過程就是崩潰恢復的主要任務,也可以成為資料庫前滾。當然,在崩潰恢復中還需要回滾沒有提交的事務,提交沒有提交成功的事務。由於回滾操作需要undo日誌的支持,undo日誌的完整性和可靠性需要redo日誌來保證,所以崩潰恢復先做redo前滾,然後做undo回滾。

我們從源碼角度仔細剖析一下資料庫崩潰恢復過程。整個過程都在引擎初始化階段完成(innobase_init),其中最主要的函數是innobase_start_or_create_for_mysql,innodb通過這個函數完成創建和初始化,包括崩潰恢復。首先來介紹一下資料庫的前滾。

redo日誌前滾資料庫

前滾資料庫,主要分為兩階段,首先是日誌掃描階段,掃描階段按照數據頁的space_id和page_no分發redo日誌到hash_table中,保證同一個數據頁的日誌被分發到同一個哈希桶中,且按照lsn大小從小到大排序。掃描完後,再遍歷整個哈希表,依次應用每個數據頁的日誌,應用完後,在數據頁的狀態上至少恢復到了崩潰之前的狀態。我們來詳細分析一下代碼。
首先,打開所有的ibdata文件(open_or_create_data_files)(ibdata可以有多個),每個ibdata文件有個flush_lsn在頭部,計算出這些文件中的max_flush_lsn和min_flush_lsn,因為ibdata也有可能有數據沒寫完整,需要恢復,後續(recv_recovery_from_checkpoint_start_func)通過比較checkpont_lsn和這兩個值來確定是否需要對ibdata前滾。
接著,打開系統表空間和日誌表空間的所有文件(fil_open_log_and_system_tablespace_files),防止出現文件句柄不足,清空buffer pool(buf_pool_invalidate)。接下來就進入最最核心的函數:recv_recovery_from_checkpoint_start_func,註意,即使資料庫是正常關閉的,也會進入。
雖然recv_recovery_from_checkpoint_start_func看過去很冗長,但是很多代碼都是為了LOG_ARCHIVE特性而編寫的,真正數據崩潰恢復的代碼其實不多。
首先,初始化一些變數,查看srv_force_recovery這個變數,如果用戶設置跳過前滾階段,函數直接返回。
接著,初始化recv_sys結構,分配hash_table的大小,同時初始化flush list rbtree。recv_sys結構主要在崩潰恢復前滾階段使用。hash_table就是之前說的用來存不同數據頁日誌的哈希表,哈希表的大小被初始化為buffer_size_in_bytes/512, 這個是哈希表最大的長度,超過就存不下了,幸運的是,需要恢復的數據頁的個數不會超過這個值,因為buffer poll最多(資料庫崩潰之前臟頁的上線)只能存放buffer_size_in_bytes/16KB個數據頁,即使考慮壓縮頁,最多也只有buffer_size_in_bytes/1KB個,此外關於這個哈希表記憶體分配的大小,可以參考bug#53122。flush list rbtree這個主要是為了加入插入臟頁列表,InnoDB的flush list必須按照數據頁的最老修改lsn(oldest_modifcation)從小到大排序,在資料庫正常運行時,可以通過log_sys->mutex和log_sys->log_flush_order_mutex保證順序,在崩潰恢復則沒有這種保證,應用數據的時候,是從第一個元素開始遍歷哈希表,不能保證數據頁按照最老修改lsn(oldest_modifcation)從小到大排序,這樣就需要線性遍歷flush_list來尋找插入位置,效率太低,因此引入紅黑樹,加快查找插入的位置。
接著,從ib_logfile0的頭中讀取checkpoint信息,主要包括checkpoint_lsn和checkpoint_no。由於InnoDB日誌是迴圈使用的,且最少要有2個,所以ib_logfile0一定存在,把checkpoint信息存在裡面很安全,不用擔心被刪除。checkpoint信息其實會寫在文件頭的兩個地方,兩個checkpoint域輪流寫。為什麼要兩個地方輪流寫呢?假設只有一個checkpoint域,一直更新這個域,而checkpoint域有512位元組(OS_FILE_LOG_BLOCK_SIZE),如果剛好在寫這個512位元組的時候,資料庫掛了,伺服器也掛了(先不考慮硬體的原子寫特性,早期的硬體沒有這個特性),這個512位元組可能只寫了一半,導致整個checkpoint域不可用。這樣資料庫將無法做崩潰恢復,從而無法啟動。如果有兩個checkpoint域,那麼即使一個寫壞了,還可以用另外一個嘗試恢復,雖然有可能這個時候日誌已經被覆蓋,但是至少提高了恢覆成功的概率。兩個checkpoint域輪流寫,也能減少磁碟扇區故障帶來的影響。checkpoint_lsn之前的數據頁都已經落盤,不需要前滾,之後的數據頁可能還沒落盤,需要重新恢復出來,即使已經落盤也沒關係,因為redo日誌時冪等的,應用一次和應用兩次都一樣(底層實現: 如果數據頁上的lsn大於等於當前redo日誌的lsn,就不應用,否則應用。checkpoint_no可以理解為checkpoint域寫盤的次數,每次刷盤遞增1,同時這個值取模2可以用來實現checkpoint_no域的輪流寫。正常邏輯下,選取checkpoint_no值大的作為最終的checkpoint信息,用來做後續崩潰恢復掃描的起始點。
接著,使用checkpoint域的信息初始化recv_sys結構體的一些信息後,就進入日誌解析的核心函數recv_group_scan_log_recs,這個函數後續我們再分析,主要作用就是解析redo日誌,如果記憶體不夠了,就直接調用應用(recv_apply_hashed_log_recs)日誌,然後再接著解析。如果需要應用的日誌很少,就僅僅解析分發日誌,到recv_recovery_from_checkpoint_finish函數中在應用日誌。
接著,依據當前刷盤的數據頁狀態做一次checkpoint,因為在recv_group_scan_log_recs里可能已經應用部分日誌了。至此recv_recovery_from_checkpoint_start_func函數結束。
recv_recovery_from_checkpoint_finish函數中,如果srv_force_recovery設置正確,就開始調用函數recv_apply_hashed_log_recs應用日誌,然後等待刷髒的線程退出(線程是崩潰恢復時臨時啟動的),最後釋放recv_sys的相關資源以及hash_table占用的記憶體。
至此,資料庫前滾結束。接下來,我們詳細分析一下redo日誌解析函數以及redo日誌應用函數的實現細節。

redo日誌解析函數

解析函數的最上層是recv_group_scan_log_recs,這個函數調用底層函數(log_group_read_log_seg),按照RECV_SCAN_SIZE(64KB)大小分批讀取。讀取出來後,首先通過block_no和lsn之間的關係以及日誌checksum判斷是否讀到了日誌最後(所以可以看出,並沒一個標記在日誌頭標記日誌的有效位置,完全是按照上述兩個條件判斷是否到達了日誌尾部),如果讀到最後則返回(之前說了,即使資料庫是正常關閉的,也要走崩潰恢復邏輯,那麼在這裡就返回了,因為正常關閉的checkpoint值一定是指嚮日志最後),否則則把日誌去頭掐尾放到一個recv_sys->buf中,日誌頭裡面存了一些控制信息和checksum值,只是用來校驗和定位,在真正的應用中沒有用。在放到recv_sys->buf之前,需要檢驗一下recv_sys->buf有沒有滿(RECV_PARSING_BUF_SIZE,2M),滿了就報錯(如果上一批解析有不完整的日誌,日誌解析函數不會分發,而是把這些不完整的日誌留在recv_sys->buf中,直到解析到完整的日誌)。接下的事情就是從recv_sys->buf中解析日誌(recv_parse_log_recs)。日誌分兩種:single_rec和multi_rec,前者表示只對一個數據頁進行一種操作,後者表示對一個或者多個數據頁進行多種操作。日誌中還包括對應數據頁的space_id,page_no,操作的type以及操作的內容(recv_parse_log_rec)。解析出相應的日誌後,按照space_id和page_no進行哈希(如果對應的表空間在記憶體中不存在,則表示表已經被刪除了),放到hash_table裡面(日誌真正存放的位置依然在buffer pool)即可,等待後續應用。這裡有幾個點值得註意:

  • 如果是multi_rec類型,則只有遇到MLOG_MULTI_REC_END這個標記,日誌才算完整,才會被分發到hash_table中。查看代碼,我們可以發現multi_rec類型的日誌被解析了兩次,一次用來校驗完整性(尋找MLOG_MULTI_REC_END),第二次才用來分發日誌,感覺這是一個可以優化的點。
  • 目前日誌的操作type有50多種,每種操作後面的內容都不一樣,所以長度也不一樣,目前日誌的解析邏輯,需要依次解析出所有的內容,然後確定長度,從而定位下一條日誌的開始位置。這種方法效率略低,其實可以在每種操作的頭上加上一個欄位,存儲後面內容的長度,這樣就不需要解析太多的內容,從而提高解析速度,進一步提高崩潰恢復速度,從結果看,可以提高一倍的速度(從38秒到14秒,詳情可以參見bug#82937)。
  • 如果發現checkpoint之後還有日誌,說明資料庫之前沒有正常關閉,需要做崩潰恢復,因此需要做一些額外的操作(recv_init_crash_recovery),比如在錯誤日誌中列印我們常見的“Database was not shutdown normally!”和“Starting crash recovery.”,還要從double write buffer中檢查是否發生了數據頁半寫,如果有需要恢復(buf_dblwr_process),還需要啟動一個線程用來刷新應用日誌產生的臟頁(因為這個時候buf_flush_page_cleaner_thread還沒有啟動)。最後還需要打開所有的表空間。。註意是所有的表。。。我們在阿裡雲RDS MySQL的運維中,常常發現資料庫hang在了崩潰恢復階段,在錯誤日誌中有類似“Reading tablespace information from the .ibd files...”字樣,這就表示資料庫正在打開所有的表,然後一看表的數量,發現有幾十甚至上百萬張表。。。資料庫之所以要打開所有的表,是因為在分發日誌的時候,需要確定space_id對應哪個ibd文件,通過打開所有的表,讀取space_id信息來確定,另外一個原因是方便double write buffer檢查半寫數據頁。針對這個表數量過多導致恢復過慢的問題,MySQL 5.7做了優化,WL#7142, 主要思想就是在每次checkpoint後,在第一次修改某個表時,先寫一個新日誌mlog_file_name(包括space_id和filename的映射),來表示對這個表進行了操作,後續對這個表的操作就不用寫這個新日誌了,當需要崩潰恢復時候,多一次掃描,通過搜集mlog_file_name來確定哪些表被修改過,這樣就不需要打開所有的表來確定space_id了。
  • 最後一個值得註意的地方是記憶體。之前說過,如果有太多的日誌已經被分發,占用了太多的記憶體,日誌解析函數會在適當的時候應用日誌,而不是等到最後才一起應用。那麼問題來了,使用了多大的記憶體就會出發應用日誌邏輯。答案是:buffer_pool_size_in_bytes - 512 * buffer_pool_instance_num * 16KB。由於buffer_pool_instance_num一般不會太大,所以可以任務,buffer pool的大部分記憶體都被用來存放日誌。剩下的那些主要留給應用日誌時讀取的數據頁,因為目前來說日誌應用是單線程的,讀取一個日誌,把所有日誌應用完,然後就可以刷回磁碟了,不需要太多的記憶體。

redo日誌應用函數

應用日誌的上層函數為recv_apply_hashed_log_recs(應用日誌也可能在io_helper函數中進行),主要作用就是遍歷hash_table,從磁碟讀取對每個數據頁,依次應用哈希桶中的日誌。應用完所有的日誌後,如果需要則把buffer_pool的頁面都刷盤,畢竟空間有限。有以下幾點值得註意:

  • 同一個數據頁的日誌必須按照lsn從小到大應用,否則數據會被覆蓋。只應用redo日誌lsn大於page_lsn的日誌,只有這些日誌需要重做,其餘的忽略。應用完日誌後,把臟頁加入臟頁列表,由於臟頁列表是按照最老修改lsn(oldest_modification)來排序的,這裡通過引入一顆紅黑樹來加速查找插入的位置,時間複雜度從之前的線性查找降為對數級別。
  • 當需要某個數據頁的時候,如果發現其沒有在Buffer Pool中,則會查看這個數據頁周圍32個數據頁,是否也需要做恢復,如果需要則可以一起讀取出來,相當於做了一次io合併,減少io操作(recv_read_in_area)。由於這個是非同步讀取,所以最終應用日誌的活兒是由io_helper線程來做的(buf_page_io_complete),此外,為了防止短時間發起太多的io,在代碼中加了流量控制的邏輯(buf_read_recv_pages)。如果發現某個數據頁在記憶體中,則直接調用recv_recover_page應用日誌。由此我們可以看出,InnoDB應用日誌其實並不是單線程的來應用日誌的,除了崩潰恢復的主線程外,io_helper線程也會參與恢復。併發線程數取決於io_helper中讀取線程的個數。

執行完了redo前滾資料庫,資料庫的所有數據頁已經處於一致的狀態,undo回滾資料庫就可以安全的執行了。資料庫崩潰的時候可能有一些沒有提交的事務或者已經提交的事務,這個時候就需要決定是否提交。主要分為三步,首先是掃描undo日誌,重新建立起undo日誌鏈表,接著是,依據上一步建立起的鏈表,重建崩潰前的事務,即恢復當時事務的狀態。最後,就是依據事務的不同狀態,進行回滾或者提交。

undo日誌回滾資料庫

recv_recovery_from_checkpoint_start_func之後,recv_recovery_from_checkpoint_finish之前,調用了trx_sys_init_at_db_start,這個函數做了上述三步中的前兩步。
第一步在函數trx_rseg_array_init中處理,遍歷整個undo日誌空間(最多TRX_SYS_N_RSEGS(128)個segment),如果發現某個undo segment非空,就進行初始化(trx_rseg_create_instance)。整個每個undo segment,如果發現undo slot非空(最多TRX_RSEG_N_SLOTS(1024)個slot),也就行初始化(trx_undo_lists_init)。在初始化undo slot後,就把不同類型的undo日誌放到不同鏈表中(trx_undo_mem_create_at_db_start)。undo日誌主要分為兩種:TRX_UNDO_INSERT和TRX_UNDO_UPDATE。前者主要是提供給insert操作用的,後者是給update和delete操作使用。之前說過,undo日誌有兩種作用,事務回滾時候用和MVCC快照讀取時候用。由於insert的數據不需要提供給其他線程用,所以只要事務提交,就可以刪除TRX_UNDO_INSERT類型的undo日誌。TRX_UNDO_UPDATE在事務提交後還不能刪除,需要保證沒有快照使用它的時候,才能通過後臺的purge線程清理。
第二步在函數trx_lists_init_at_db_start中進行,由於第一步中,已經在記憶體中建立起了undo_insert_list和undo_update_list(鏈表每個undo segment獨立),所以這一步只需要遍歷所有鏈表,重建起事務的狀態(trx_resurrect_inserttrx_resurrect_update)。簡單的說,如果undo日誌的狀態是TRX_UNDO_ACTIVE,則事務的狀態為TRX_ACTIVE,如果undo日誌的狀態是TRX_UNDO_PREPARED,則事務的狀態為TRX_PREPARED。這裡還要考慮變數srv_force_recovery的設置,如果這個變數值為非0,所有的事務都會回滾(即事務被設置為TRX_ACTIVE),即使事務的狀態應該為TRX_STATE_PREPARED。重建起事務後,按照事務id加入到trx_sys->trx_list鏈表中。最後,在函數trx_sys_init_at_db_start中,會統計所有需要回滾的事務(事務狀態為TRX_ACTIVE)一共需要回滾多少行數據,輸出到錯誤日誌中,類似:5 transaction(s) which must be rolled back or cleaned up。InnoDB: in total 342232 row operations to undo的字樣。
第三步的操作在兩個地方被調用。一個是在recv_recovery_from_checkpoint_finish的最後,另外一個是在recv_recovery_rollback_active中。前者主要是回滾對數據字典的操作,也就是回滾DDL語句的操作,後者是回滾DML語句。前者是在資料庫可提供服務之前必須完成,後者則可以在資料庫提供服務(也即是崩潰恢復結束)之後繼續進行(通過新開一個後臺線程trx_rollback_or_clean_all_recovered來處理)。因為InnoDB認為數據字典是最重要的,必須要回滾到一致的狀態才行,而用戶表的數據可以稍微慢一點,對外提供服務後,慢慢恢復即可。因此我們常常在會發現資料庫已經啟動起來了,然後錯誤日誌中還在不斷的列印回滾事務的信息。事務回滾的核心函數是trx_rollback_or_clean_recovered,邏輯很簡單,只需要遍歷trx_sys->trx_list,按照事務不同的狀態回滾或者提交即可(trx_rollback_resurrected)。這裡要註意的是,如果事務是TRX_STATE_PREPARED狀態,那麼在InnoDB層,不做處理,需要在Server層依據binlog的情況來決定是否回滾事務,如果binlog已經寫了,事務就提交,因為binlog寫了就可能被傳到備庫,如果主庫回滾會導致主備數據不一致,如果binlog沒有寫,就回滾事務。

崩潰恢復相關參數解析

innodb_fast_shutdown:
innodb_fast_shutdown = 0。這個表示在MySQL關閉的時候,執行slow shutdown,不但包括日誌的刷盤,數據頁的刷盤,還包括數據的清理(purge),ibuf的合併,buffer pool dump以及lazy table drop操作(如果表上有未完成的操作,即使執行了drop table且返回成功了,表也不一定立刻被刪除)。
innodb_fast_shutdown = 1。這個是預設值,表示在MySQL關閉的時候,僅僅把日誌和數據刷盤。
innodb_fast_shutdown = 2。這個表示關閉的時候,僅僅日誌刷盤,其他什麼都不做,就好像MySQL crash了一樣。
這個參數值越大,MySQL關閉的速度越快,但是啟動速度越慢,相當於把關閉時候需要做的工作挪到了崩潰恢覆上。另外,如果MySQL要升級,建議使用第一種方式進行一次乾凈的shutdown。

innodb_force_recovery:
這個參數主要用來控制InnoDB啟動時候做哪些工作,數值越大,做的工作越少,啟動也更加容易,但是數據不一致的風險也越大。當MySQL因為某些不可控的原因不能啟動時,可以設置這個參數,從1開始逐步遞增,知道MySQL啟動,然後使用SELECT INTO OUTFILE把數據導出,盡最大的努力減少數據丟失。
innodb_force_recovery = 0。這個是預設的參數,啟動的時候會做所有的事情,包括redo日誌應用,undo日誌回滾,啟動後臺master和purge線程,ibuf合併。檢測到了數據頁損壞了,如果是系統表空間的,則會crash,用戶表空間的,則打錯誤日誌。
innodb_force_recovery = 1。如果檢測到數據頁損壞了,不會crash也不會報錯(buf_page_io_complete),啟動的時候也不會校驗表空間第一個數據頁的正確性(fil_check_first_page),表空間無法訪問也繼續做崩潰恢復(fil_open_single_table_tablespacefil_load_single_table_tablespace),ddl操作不能進行(check_if_supported_inplace_alter),同時資料庫也被不能進行寫入操作(row_insert_for_mysqlrow_update_for_mysql等),所有的prepare事務也會被回滾(trx_resurrect_inserttrx_resurrect_update_in_prepared_state)。這個選項還是很常用的,數據頁可能是因為磁碟壞了而損壞了,設置為1,能保證資料庫正常啟動。
innodb_force_recovery = 2。除了設置1之後的操作不會運行,後臺的master和purge線程就不會啟動了(srv_master_threadsrv_purge_coordinator_thread等),當你發現資料庫因為這兩個線程的原因而無法啟動時,可以設置。
innodb_force_recovery = 3。除了設置2之後的操作不會運行,undo回滾資料庫也不會進行,但是回滾段依然會被掃描,undo鏈表也依然會被創建(trx_sys_init_at_db_start)。srv_read_only_mode會被打開。
innodb_force_recovery = 4。除了設置3之後的操作不會運行,ibuf的操作也不會運行(ibuf_merge_or_delete_for_page),表信息統計的線程也不會運行(因為一個壞的索引頁會導致資料庫崩潰)(info_lowdict_stats_update等)。從這個選項開始,之後的所有選項,都會損壞數據,慎重使用。
innodb_force_recovery = 5。除了設置4之後的操作不會運行,回滾段也不會被掃描(recv_recovery_rollback_active),undo鏈表也不會被創建,這個主要用在undo日誌被寫壞的情況下。
innodb_force_recovery = 6。除了設置5之後的操作不會運行,資料庫前滾操作也不會進行,包括解析和應用(recv_recovery_from_checkpoint_start_func)。

總結

InnoDB實現了一套完善的崩潰恢復機制,保證在任何狀態下(包括在崩潰恢復狀態下)資料庫掛了,都能正常恢復,這個是與文件系統最大的差別。此外,崩潰恢復通過redo日誌這種物理日誌來應用數據頁的方法,給MySQL Replication帶來了新的思路,備庫是否可以通過類似應用redo日誌的方式來同步數據呢?阿裡雲RDS MySQL團隊在後續的產品中,給大家帶來了類似的特性,敬請期待。


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