linux 的一些腦洞操作

把當前文件夾的文件名用"，"連接成一行，或者將多行轉變為一行

ls | paste -s -d ","  # -s 選項將輸入進行一次性粘貼
ls | xargs | sed 's/ /,/g'  #xargs 將輸入作為參數(空格分隔)傳入
ls | awk '{printf "%s,",$0}'

將行逆序輸出

sed '1!G;h;$!d’'file  # 1!G 第一行不執行G命令，從第二行開始執行；$!d 最後一行不刪除；第一行自動存入模式空間，將模式空間內容（第一行）放到保持空間(h)，然後刪除模式空間內容(d，否則它會自動輸出)，第二行自動存入模式空間，（開始用G）將保持空間（第一行內容）接到模式空間（第二行）後，將當前模式空間（第二行+第一行）放到保持空間（h），然後刪除當前模式空間(d)，依次類推，最後一行不刪除模式空間，再自動輸出模式空間內容

刪除#開頭的註釋行

sed '/^#.*/d' test.txt

去掉每行開頭4個字元

cut -c 4- test.csv

對文件第一列進行統計

awk -F "," '{count[$1]++} END{for (record in count) print record,count[record] }' test.csv  #count[$1]++創建關聯數組count[$1]併進行計數

對文件第四列用"："切割成兩列並將最後一列結果+1，然後輸出全部列

awk -F "," '{split($4,array,":");print $1,$2,$3,array[1],array[2]+1}' test.csv  #split切割$4存到數組array中，array[1]和arrya[2]即為切割後的兩個區域

對文件第二列求均值

awk -F "," '{sum+=$2} END {print "Average = ", sum/NR}' test.csv

實現DNA序列反向互補

cat seq.txt | sed 'y/ATGC/TACG/' |rev

某一行插入另外一個文件的內容

sed '2 r a.txt' test.csv 

對一個文件按照第一列進行篩選，篩選條件是必須在另外一個文件的第一列出現過

awk -F "," '{if(NR==FNR){count[$1]=1}else if(count[$1]==1){print $0}}' chr.txt test.csv  #將第一個文件第一列的值存入關聯數組，並給值為1，如果第二個文件建立的關聯數組對應值為1，說明在第一個文件第一列出現過，則輸出整行

對文件第二列和第三列進行展開

展開前四列

展開後成為三列

awk -F "," '{for (i=$2;i<=$3;i++) {print $1,i,$4}}'  test.csv