R提高篇(二): 圖形初階

来源:http://www.cnblogs.com/tgzhu/archive/2016/10/09/5942137.html
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目錄: 圖形示例 圖形參數 符號、線條 顏色 文本屬性 尺寸與邊界 自定義標題 自定義坐標軸 圖例 文本標註 圖形組合 圖形示例 如下代碼描述病人對兩種藥物五個劑量水平上的響應情況 > mydata <- data.frame(dose=numeric(0),drugA=numeric(0),dru ...


目錄:

  • 圖形示例
  • 圖形參數
  • 符號、線條
  • 顏色
  • 文本屬性
  • 尺寸與邊界
  • 自定義標題
  • 自定義坐標軸
  • 圖例
  • 文本標註
  • 圖形組合

圖形示例


  • 如下代碼描述病人對兩種藥物五個劑量水平上的響應情況
    > mydata <- data.frame(dose=numeric(0),drugA=numeric(0),drugB=numeric(0))
    > fix(mydata)
    > mydata
    > save(mydata,file = "mydata.rda") dose drugA drugB
    1 20 16 15 2 30 20 18 3 40 27 25 4 45 40 31 5 60 60 40 >
  • 創建圖形,代碼如下:
    with(mydata,{
      plot(dose,drugA,type="b")
    })
  •  圖形如下:

圖形參數


  • 通過修改參數,可對圖形的字體、顏色、坐標軸、標簽進行進行修改
  • par(optionname=value, optionname = value ......) , 用這種方式設定的參數除非被修改,否則在會話結束前一直有效
  • par() 生成一個含有當前圖形參數設置的列表,添加參數 no.readonly = TRUE 生成一個可修改的當前圖形參數列表
  • 如下圖:使用虛線和實心三角點,示例代碼如下:
    load("mydata.rda")
    par(no.readonly = TRUE)
    par(lty=2)
    par(pch=17)   #這兩句等價於:par(lty=2,pch=17)
    with(mydata,{
      plot(dose,drugA,type="b")    #使用par參數等價於plot(dose,drugA,type="b",lty=2,pch=17   
    })
  • 生成圖例如下:

 符號和線條


  1. pch:  指定繪製點時使用的符號,如下圖:
  2. cex: 指定符號的大小,是一個數值,表示繪圖符號相對於預設大小的縮放比例
  3. ltype: 指定線條類型,如下圖:
  4. lwd: 指定線條寬度,相於於預設值1的倍數,如:2, 0.5等

 顏色


  • R中,可通過顏色下標(如:col =1 )、顏色名稱(col="Red")、十六進位(col="#FFFF")、RGB值(col=rgb(1,1,1))、HSV值(col=hsv(0,0,1))來指定顏色
  • 顏色參數如下:
    1. col:            預設的繪圖顏色
    2. col.axis:    坐標軸刻度文字的顏色
    3. col.lab:     坐標軸標簽(名稱)的顏色
    4. col.main:  標題顏色
    5. col.sub:    副標題顏色
    6. fg:            圖形的前景色
    7. bg:           圖形的背景色

文本屬性


  • 指定文本大小參數
    1. cex.axis:          坐標刻度文字的縮放倍數
    2. cex.lab:           坐標標簽的縮放倍數
    3. cex.main:        標題的縮放倍數
    4. cex.sub:          副標題的縮放倍數
  • 指定文件字體樣式:
    1. font:             整數,1=常規,2=粗體,3=斜體,4=粗斜體,5=符號字體
    2. font.axis:      坐標刻度文字的字體樣式
    3. font.lab:      坐標標簽的字體樣式
    4. font.main:     標題的字體樣式
    5. font.sub:       副標題的字體樣式
    6. ps:                字體磅值

尺寸與邊界


  • 尺寸與邊界參數:
    1. pin:       以英寸表示圖形的尺寸(寬和高)
    2. mai:      在數值向量表示邊界大小,順序為:下、左、上、右,單位為英寸
    3. mar:      在數值向量表示邊界大小,順序為:下、左、上、右,單位為英分(一英分 = 1/12 英寸,相當於0.21釐米)
  • 示例代碼及圖例:
    setwd("E:\\R")
    load("mydata.rda")
    par(no.readonly = TRUE)
    par(pin=c(2,3),lwd=2,cex=1.5,cex.axis=0.75,font.axis=3)
    with(mydata,{
      plot(dose,drugA,type="b",pch=19,lty=2,col="red")
      plot(dose,drugB,type="b",pch=23,lty=6,col="blue",bg="green")
    })
  • 圖形大小寬高為:2英寸、3英寸,線條寬度為預設2位、符號為預設1.5倍、坐標軸文字設置為粗體,大小縮小為75%,par設定的參數對兩張圖均有效,plot中的參數僅對特定圖形有效

自定義標題


  • title()一般用於添加信息到一個預設標題和坐標軸標簽被 ann=FALSE 選項移除的圖形中
  • 示例代碼和圖形:
    load("mydata.rda")
    with(mydata,{
      plot(dose,drugA,type="b",pch=19,lty=2,ann=FALSE)
      title(main="hello",sub="demo",col.main="red",col.sub="green",xlab = "jl",ylab="fy")
    })
  • 示例結果

自定義坐標軸


  • axis()用來自定義坐標軸,而非使用R中的預設坐標田軸
  • 語法: axis(side, at = NULL, labels = TRUE, pos = NA, las=, ...)
  • 參數說明如下:
    1. side:   表示在圖形的哪邊繪製坐標軸: 1=下,2=左,3=上,4=右
    2. at:      一個數值型向量,表示需要繪製刻度線的位置
    3. labels: 字元向量,表示置於刻度線旁邊的文字標簽
    4. las:     標簽是否平行於(=0)或垂直於(=2)於坐標軸
  • 示例代碼:
    with(mydata,{
      plot(dose,drugA,type="b",pch=19,lty=2,yaxt="n")
      axis(2,at=c(20,30,40,50,60),labels = c('A','B','C','D','E'),las=2,col="blue")
    })
  • 意:創建自定義坐標時,應當禁用自動生成的坐標軸
    1. axes = FALSE 將禁用全部的坐標軸(包括坐標軸框架線、除非添加參數 frame.plot = TRUE)
    2. xaxt = "n" 和 yaxt = "n" 將分別禁用X軸和Y軸(會留下框架線、只是去除了刻度)

 圖例


  • legend(): 當圖形中有多組數據時,圖例可幫助每個圖形代表的數據
  • 語法:legend(location,title,legend,........)
  • 參數說明:
    1. location:   圖例顯示位置,可使用關鍵字:bottom、bottomleft、left、topleft、top、topright、right、bottomright、center, 使用 inset=指定圖例內側移動的大小 (以繪圖區域大小分數表示)
    2. title:          可選項,圖例標題
    3. legend:      圖例標簽組成的字元串向量
    4. ......
  • 示例代碼:
    setwd("E:\\R")
    load("mydata.rda")
    dose <- mydata$dose
    drugA <- mydata$drugA
    drugB <- mydata$drugB
    plot(dose,drugA,type="b", pch=15,lty=1,col="red",ylim = c(0,60),main="Drug A vs.Drug B",xlab = "Drug dosage",ylab="drug Repsponse")
    lines(dose,drugB,type = "b",pch=17,lty=2,col="blue")
    abline(h=c(30),lty=2,lwd=1.5,col="gray")
    legend("topleft",inset = 0.05, title = "drug Type",legend = c("A","B"),lty=c(1,2),pch=c(15,17),col=c("red","blue"))
  • 展現結果如下圖:
  • abline(): 參考線函數,語法:abline(h=yvalues, v=xvalues)

文本標註


  • text():   向繪圖區域內添加文本
  • mtext(): 向圖形的四個邊角之一添加文本
  • 語法: text(location, "text to place", pos, .....)
  • 參數解釋:
    1. location:   文本的位置參數
    2. pos:           文本相對於位置參數的方位,1=下,2=左,3=上,4=右, 可同時配合參數 offset=作為偏移量
  • 示例代碼:
    wt <- mtcars$wt
    mpg <- mtcars$mpg
    plot(wt,mpg,main="Mileage vs. Car weight",xlab="weight",ylab="Mileage",pch=18,col="blue")
    text(wt,mpg,row.names(mtcars),cex = 0.5, pos=4,offset = 0.4,col="red")
  • 顯示效果圖如下:

圖形組合


  • 使用par() 、layout()比較容易組合多幅圖為一幅總括圖
  • par()使用mfrow=c(nrows,ncols) 創建按行填充的圖形矩陣, mfcol=c(nrows,ncols) 按列填充矩陣
  • 示例代碼:
    attach(mtcars)
    opar <- par(no.readonly = TRUE)
    par(mfrow=c(2,2))
    plot(wt,mpg,main="Demo1")
    plot(wt,disp,main="Demo2")
    hist(wt,main="demo3")
    boxplot(wt,main="demo4")
    par(opar)
    detach(mtcars)
  • 結果示例:
  • layout() 調用 layout(mat),其中 mat是一個矩陣,它指定要組合的多個圖形所在的位置
  • 示例代碼:
    attach(mtcars)
    layout(matrix(c(1,1,2,3),nrow = 2,ncol = 2,byrow = TRUE))
    hist(wt,main = "demo1")
    hist(mpg,main = "demo2")
    hist(disp,main = "demo3")
    detach(mtcars)
  • 示例結果顯示

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